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基因體中心

★ 三大基因資料庫

☆ NCBI：Nucleotide-nucleotide BLAST。
☆ EBI：ClustalW、Align。
☆ DDBJ

★ GenomeNet ★ Sanger Centre

其他相關

★ KEGG Metabolic Pathways ★ GeneCards ★ ExPasy
★ Primer3 ★ CHANGE Cross-Hybridization Analysis Network of Gene Expression
★ Phylodendron - Phylogenetic tree printer
★ BioGuide - PCR Programs for designing PCR primers
★ 中國Jemboss ★ NHRI 研究資源 ★ 生物資訊學會 ★ 陽明生物資訊學程

　

  1. 搜尋文獻資料: PubMED

  2. 擷取基因序列: Entrez

  3. 尋找基因相關資料: GeneCard, OMIM...

  4. 分析基因與疾病之關係: OMIM, NCBI - Gene and Disease

  5. 尋找相似 (同種 or 不同種) 基因: BLAST

  6. 分析基因結構 (promoter, exon, intron, 5'UTR, 3'UTR...): GeneCard, NCBI-genome DB

  7. 尋找 polymorphism base: ClustW

  8. 多基因比較分析: ClustW

  9. DNA -> Protein: ExPasy 的 Translate

  10. 尋找適當切位，marker(酵素)預測PCR結果: E-PCR

  11. 設計 primer: Primer3, CHANGE

  12. 如何發現新基因: est

  13. 如何使用 Jemboss

  14. 如何尋找代謝的相關資料: KEGG

核酸及蛋白質序列資料庫

★ GenBank ★ EMBL ★ DDBJ ★ GDB ★ FlyBase ★ MGI
★ PIR ★ TIGR ★ Swiss-Prot ★ HGMD ★ Codon Usage Database

結構與功能性資料庫

★ PDB ★ Pfam ★ SCOP ★ KEGG ★ TransFac ★ DIP 
★ TRRD ★ CATH ★ ProDom ★ MINT

分析工具與網站

★ EMBOSS ★ ExPasy ★ ENSEMBL ★ NCSA,
★ HGMP ★ BCM ★ CMBI ★ CBR ★ CBS ★ Primer3 ★ PRINTS ★ SRS,
★ SeWeR ★ Blocks ★ GeneCards ★ Pedro's BioMolecular Research Tools
★ AceDB ★ WorkBench ★ SMART ★ GeneBee

基因註解工具

★ GENSCAN ★ GenomeScan ★ AAT ★ GrailEXP ★ SpliceSite,
★ eMOTIF ★ Genie ★ FSED ★ tRNAscan |